Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN3Q969G5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN3Q969G5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms