Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAMP4Q969E2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms