Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-CQ95604 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms