Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF25Q93038 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF25Q93038 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms