Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB1CQ92928 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms