Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRAT1Q92837 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms