Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABGGTAQ92696 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABGGTAQ92696 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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