Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDEM1Q92611 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDEM1Q92611 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms