Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSMEM1Q8WWF3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSMEM1Q8WWF3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms