Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJA4Q8WW22 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJA4Q8WW22 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms