Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms