Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM4

PDCD6IP, Programmed cell death 6-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6IPQ8WUM4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD6IPQ8WUM4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD6IPQ8WUM4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD6IPQ8WUM4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD6IPQ8WUM4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD6IPQ8WUM4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD6IPQ8WUM4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD6IPQ8WUM4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD6IPQ8WUM4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms