Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PANK1Q8TE04 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PANK1Q8TE04 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms