Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R17PQ8TDU5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms