Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX54Q8TDD1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX54Q8TDD1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms