Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM71BQ8TC56 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM71BQ8TC56 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms