Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC148Q8NFR7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC148Q8NFR7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms