Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT1Q8NF37 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms