Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPATA4Q8NEY3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA4Q8NEY3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms