Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CARMIL3Q8ND23 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms