Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARRDC4Q8NCT1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARRDC4Q8NCT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARRDC4Q8NCT1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARRDC4Q8NCT1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARRDC4Q8NCT1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARRDC4Q8NCT1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARRDC4Q8NCT1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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