Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC44A5Q8NCS7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC44A5Q8NCS7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms