Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM35BQ8NCS4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM35BQ8NCS4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms