Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD1Q8NBU5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD1Q8NBU5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms