Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLGALT1Q8NBJ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLGALT1Q8NBJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms