Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHCHD4Q8N4Q1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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