Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf62Q8N4C0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms