Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SDR16C5Q8N3Y7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR16C5Q8N3Y7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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