Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C17orf53Q8N3J3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms