Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NME9Q86XW9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NME9Q86XW9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NME9Q86XW9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms