Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPH3Q86UC2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH3Q86UC2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms