Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2Q1Q7Z7E8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2Q1Q7Z7E8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2Q1Q7Z7E8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2Q1Q7Z7E8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2Q1Q7Z7E8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2Q1Q7Z7E8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2Q1Q7Z7E8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2Q1Q7Z7E8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2Q1Q7Z7E8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms