Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLASP1Q7Z460 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLASP1Q7Z460 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms