Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APTXQ7Z2E3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APTXQ7Z2E3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APTXQ7Z2E3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms