Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD4Q76G19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD4Q76G19 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms