Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00173Q6ZV60 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms