Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC149Q6ZUS6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC149Q6ZUS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms