Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LINC00336Q6ZUF6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LINC00336Q6ZUF6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00336Q6ZUF6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00336Q6ZUF6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00336Q6ZUF6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00336Q6ZUF6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00336Q6ZUF6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00336Q6ZUF6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LINC00336Q6ZUF6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00336Q6ZUF6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00336Q6ZUF6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00336Q6ZUF6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00336Q6ZUF6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00336Q6ZUF6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00336Q6ZUF6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00336Q6ZUF6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00336Q6ZUF6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00336Q6ZUF6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00336Q6ZUF6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00336Q6ZUF6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LINC00336Q6ZUF6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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