Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms