Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms