Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CD109Q6YHK3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CD109Q6YHK3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CD109Q6YHK3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms