Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1Q6UXZ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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