Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
CCBE1Q6UXH8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCBE1Q6UXH8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms