Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL17Q6UXB2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL17Q6UXB2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms