Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPSL2Q6UWE3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms