Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUX4L9Q6RFH8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4L9Q6RFH8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.6 ms