Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LGALS9CQ6DKI2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LGALS9CQ6DKI2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms