Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E4F1Q66K89 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E4F1Q66K89 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms