Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL1Q5VZK9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms