Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms