Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP9Q5VTM2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms